1、要充分考慮工作流程、樣品的轉運和人員流動、各科室區位分布、生物安全因素等。

　　2、要使無菌室在格局和功能上保持其合理性和適用性、均衡性，充分發揮期應有的作有。

　　3、無菌室的設計要考慮到是否能否適應未來發展變化的需要的增值性。

　　4、要注重無菌室設計上的通氣性、通風性、恒溫恒濕處要求。

　　5、充分考慮和保證無菌室安全性，滿足緊急清除污物垃圾和疏散疏散的出口等建筑規則，針對需要的配備相關安全設備。

　　6、無菌室在材料和設計上要考慮防潮、耐腐蝕、不掉色、平整、易清潔、不滲水、門窗密閉性和構造牢固性等。

　　7、無菌室設計上要考慮要便于定期消毒、滅菌的實施和便于各類消殺的用具的擺放等。

　　8、無菌室設計要充分考慮相關配套設備、電力、電源、水管路、裝修的配套性、齊全性，最大化的發揮其應有的功能。